Durante la notte le piante non consumano CO2 e quindi il suo utilizzo è inutile se non addirittura dannoso: l'eccesso di CO2 che si accumula durante la notte può provocare un pericoloso abbassamento del pH e creare problemi respiratori ai pesci essendo la CO2 antagonista dell'ossigeno. Il problema si può verificare soprattutto se forniamo una gran quantità di CO2 per la folta vegetazione; se invece l'acquario è mediamente popolato di piante, i rischi sono quasi nulli.